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日本産カンキツトリステザウイルス分離株のRT-PCR-RFLP分析と弱毒株の干渉効果評価への適用
https://doi.org/10.24514/00001839
https://doi.org/10.24514/00001839d208c85b-9771-46fa-80a3-2f75464e36a6
名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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nifs_report_No5p63-70p.pdf (3.4 MB)
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Item type | 紀要論文01 / Departmental Bulletin Original Article(1) | |||||
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公開日 | 2019-03-22 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | 日本産カンキツトリステザウイルス分離株のRT-PCR-RFLP分析と弱毒株の干渉効果評価への適用 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis of Citrus Tristeza Virus Isolates in Japan and its Application to Cross-protection Experiments | |||||
言語 | en | |||||
言語 | ||||||
言語 | eng | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | Citrus tristeza virus | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | strain discrimination | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | diagnosis | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | cross-protection | |||||
キーワード | ||||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | RT-PCR-RFLP | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | Citrus tristeza virus | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | strain discrimination | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | diagnosis | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | cross-protection | |||||
キーワード | ||||||
言語 | en | |||||
主題Scheme | Other | |||||
主題 | RT-PCR-RFLP | |||||
資源タイプ | ||||||
資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||
資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||
ID登録 | ||||||
ID登録 | 10.24514/00001839 | |||||
ID登録タイプ | JaLC | |||||
著者 |
加納, 健
× 加納, 健× 夏秋, 知英× 井坂, 正大× SUASTIKA, Gede× 奥田, 誠一× 家城, 洋之 |
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抄録 | ||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||
内容記述 | Several primer pairs were designed between open reading frame 6 and the 3'untranslated region for amplification of Citrus tristeza virus (CTV) complementary DNA (cDNA). Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) followed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the PCR products using an appropriate combination of primer pairs and restriction enzymes was shown to be useful for distinguishing diverse CTV isolates in Japan. Three distinct experiments to investigate cross-protection against severe CTV infection were carried out using two mild isolates (Ml5A and M23A). The mild isolate Ml5A was previously reported to be a promising protective isolate. Ml5A, however, cannot be distinguished from severe isolates by means of existing monoclonal antibody techniques. Our work also demonstrates that RT-PCR-RFLP can be successfully applied to evaluation of the protective ability of mild isolates Ml5A and M23A against severe CTV isolates, since the results of RT-PCR-RFLP coincided with those of symptom observations in the cross-protection experiments. | |||||
抄録 | ||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||
内容記述 | カンキツトリステザウイルス(CTV)のopen reading frame 6と3' 末端非翻訳領域の間にCTV相補DNAを増幅するためのいくつかのプライマーペアを設計した。これらのプライマーペアと制限酵素を組み合わせてRT-PCR-RFLP分析することにより、日本産の異なるCTV分離株を識別することができた。本手法がCTV弱毒株の強毒株に対する千渉効果の評価に有効であるか調べるため、弱毒株(Ml5AまたはM23A)を用いた干渉効果試験に本手法を適用した。Ml5Aは干渉効果能が高いことが報告されているが、既存のモノクローナル抗体で強毒株と識別できない分離株である。これらの試験において、RT-PCR-RFLPの結果は病徴観察結果と一致し、また、評価期間短縮の可能性が示唆された。 | |||||
書誌情報 |
果樹研究所研究報告 en : Bulletin of the National Institute of Fruit Tree Science 巻 5, p. 63-70, 発行日 2006-03-01 |
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出版者 | ||||||
出版者 | 独立行政法人 農業・生物系特定産業技術研究機構 果樹研究所 | |||||
ISSN | ||||||
収録物識別子タイプ | ISSN | |||||
収録物識別子 | 1347-3549 | |||||
DOI | ||||||
関連タイプ | isIdenticalTo | |||||
識別子タイプ | DOI | |||||
関連識別子 | 10.24514/00001839 | |||||
著者版フラグ | ||||||
出版タイプ | VoR | |||||
出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |