| アイテムタイプ |
紀要論文01 / Departmental Bulletin Original Article(1) |
| 公開日 |
2019-12-20 |
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タイトル |
臭気低減化細菌の16S rDNA遺伝子配列解析による系統分類 |
| タイトル |
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タイトル |
Comparative 16S rDNA gene sequence analyses of the deodorant bacterial strains isolated from composting of animal feces |
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言語 |
en |
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言語 |
jpn |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
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資源タイプ |
departmental bulletin paper |
| ID登録 |
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ID登録 |
10.24514/00002498 |
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ID登録タイプ |
JaLC |
| 著者 |
佐藤, 留美
蒲生, 卓磨
島, 純
川本, 伸一
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| 抄録 |
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内容記述タイプ |
Abstract |
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内容記述 |
Almost entire region (about 1.5 kb) of 16S rDNA gene was PCR-amplified and sequenced for the 12 deodorant bacterial strains isolated from composting of animal feces. These strains had been classified into five groups based on the deodorizing malodorous compounds; group 1, hydrogen sulfide (one strain): group 2, volatile fatty acids and sulfur compounds (one strain): group 3, methylmercaptane (three strains): group 4, trimethylamine (five strains): group 5, ammonia (two strains). Sequence analysis of the 16S rDNA gene among the 12 strains revealed that strains in the same group are highly homologous (more than 99% similarity) and could be recognized as a single taxon at the species level. By phylogenetic tree analysis of the 16S rDNA gene sequence using a CLATALW program, the strains in group 1 and 2 were identified as Brevibacterium sp. and Rhodococcus sp., respectively, and the other strains were all identified as Bacillus sp.. |
| 抄録 |
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内容記述タイプ |
Abstract |
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内容記述 |
堆肥より分離された臭気低減活性を有する細菌12株【硫化水素低減活性1株 (グループ1), 低級脂肪酸類・硫黄化合物類低減活性1株 (グループ2), メチルメルカプタン低減活性3株 (グループ3), トリメチルアミン低減活性5株 (グループ4), アンモニア低減活性2株 (グループ5)】について, 16Sr DNA遺伝子塩基配列解析による系統分類を行った。その結果, グループ内の菌株間で16S rDNA遺伝子塩基配列の相同性が極めて高い(99%以上) ことが明らかとなった。さらに既知細菌群とのCRASTALWプログラムによる分類学的系統樹作成により, グループ1とグループ2の株は, それぞれBrevibacterium sp. とRhodococcus sp.とその他のグループの株はすべてBaczillus sp. と同定した。 |
| 書誌情報 |
食品総合研究所研究報告
en : Report of National Food Research Institute
巻 66,
p. 9-14,
発行日 2002-03-01
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| 出版者 |
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出版者 |
農業・食品産業技術総合研究機構 |
| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
0301-9780 |
| DOI |
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関連タイプ |
isIdenticalTo |
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識別子タイプ |
DOI |
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関連識別子 |
10.24514/00002498 |
| 著者版フラグ |
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出版タイプ |
VoR |
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出版タイプResource |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
nfri_report_No66p9-14p (522.3 kB)
