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臭気低減化細菌の16S rDNA遺伝子配列解析による系統分類
https://doi.org/10.24514/00002498
https://doi.org/10.24514/0000249865d87f4f-0b74-419c-8c0c-f35d028f55e5
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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nfri_report_No66p9-14p (522.3 kB)
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| Item type | 紀要論文01 / Departmental Bulletin Original Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2019-12-20 | |||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | 臭気低減化細菌の16S rDNA遺伝子配列解析による系統分類 | |||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Comparative 16S rDNA gene sequence analyses of the deodorant bacterial strains isolated from composting of animal feces | |||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録 | 10.24514/00002498 | |||||||||||||||||||||||||||||
| ID登録タイプ | JaLC | |||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
佐藤, 留美
× 佐藤, 留美
× 蒲生, 卓磨
× 島, 純
× 川本, 伸一
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Almost entire region (about 1.5 kb) of 16S rDNA gene was PCR-amplified and sequenced for the 12 deodorant bacterial strains isolated from composting of animal feces. These strains had been classified into five groups based on the deodorizing malodorous compounds; group 1, hydrogen sulfide (one strain): group 2, volatile fatty acids and sulfur compounds (one strain): group 3, methylmercaptane (three strains): group 4, trimethylamine (five strains): group 5, ammonia (two strains). Sequence analysis of the 16S rDNA gene among the 12 strains revealed that strains in the same group are highly homologous (more than 99% similarity) and could be recognized as a single taxon at the species level. By phylogenetic tree analysis of the 16S rDNA gene sequence using a CLATALW program, the strains in group 1 and 2 were identified as Brevibacterium sp. and Rhodococcus sp., respectively, and the other strains were all identified as Bacillus sp.. | |||||||||||||||||||||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | 堆肥より分離された臭気低減活性を有する細菌12株【硫化水素低減活性1株 (グループ1), 低級脂肪酸類・硫黄化合物類低減活性1株 (グループ2), メチルメルカプタン低減活性3株 (グループ3), トリメチルアミン低減活性5株 (グループ4), アンモニア低減活性2株 (グループ5)】について, 16Sr DNA遺伝子塩基配列解析による系統分類を行った。その結果, グループ内の菌株間で16S rDNA遺伝子塩基配列の相同性が極めて高い(99%以上) ことが明らかとなった。さらに既知細菌群とのCRASTALWプログラムによる分類学的系統樹作成により, グループ1とグループ2の株は, それぞれBrevibacterium sp. とRhodococcus sp.とその他のグループの株はすべてBaczillus sp. と同定した。 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
食品総合研究所研究報告 en : Report of National Food Research Institute 巻 66, p. 9-14, 発行日 2002-03-01 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | 農業・食品産業技術総合研究機構 | |||||||||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 0301-9780 | |||||||||||||||||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 10.24514/00002498 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||
