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Optimized inhibition assays reveal different inhibitory responses of hydroxylamine oxidoreductases from beta- and gamma-proteobacterial ammonium-oxidizing bacteria
https://repository.naro.go.jp/records/132
https://repository.naro.go.jp/records/132e1a21333-4401-478b-91fc-1573b39eefc6
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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SC30201706260002_PostPrint.pdf (3.4 MB)
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.png)
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| Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2016-05-10 | |||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Optimized inhibition assays reveal different inhibitory responses of hydroxylamine oxidoreductases from beta- and gamma-proteobacterial ammonium-oxidizing bacteria | |||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Optimized inhibition assays reveal different inhibitory responses of hydroxylamine oxidoreductases from beta- and gamma-proteobacterial ammonium-oxidizing bacteria | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Nitrification inhibitor | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Inhibitor screening | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Hydroxylamine oxidoreductase | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Ammonia-oxidizing bacteria | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Phenylhydrazine | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Nitrification inhibitor | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Inhibitor screening | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Hydroxylamine oxidoreductase | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Ammonia-oxidizing bacteria | |||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||
| 主題 | Phenylhydrazine | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||
| 著者 |
西ヶ谷, 有輝
× 西ヶ谷, 有輝
× 藤本, 瑞
× 山崎, 俊正
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Ammonia-oxidizing bacteria (AOB), ubiquitous chemoautotrophic bacteria, convert ammonia (NH3) to nitrite (NO2−) via hydroxylamine as energy source. Excessive growth of AOB, enhanced by applying large amounts of ammonium-fertilizer to the farmland, leads to nitrogen leaching and nitrous oxide gas emission. To suppress these unfavorable phenomena, nitrification inhibitors, AOB specific bactericides, are widely used in fertilized farmland. However, new nitrification inhibitors are desired because of toxicity and weak-effects of currently used inhibitors. Toward development of novel nitrification inhibitors that target hydroxylamine oxidoreductase (HAO), a key enzyme of nitrification in AOB, we established inhibitor evaluation systems that include simplified HAO purification procedure and high-throughput HAO activity assays for the purified enzymes and for the live AOB cells. The new assay systems allowed us to observe distinct inhibitory responses of HAOs from beta-proteobacterial AOB (βAOB) Nitrosomonas europaea (NeHAO) and gamma-proteobacterial AOB (γAOB) Nitrosococcus oceani (NoHAO) against phenylhydrazine, a well-known suicide inhibitor for NeHAO. Consistently, the live cells of N. europaea, Nitrosomonas sp. JPCCT2 and Nitrosospira multiformis of βAOB displayed higher responses to phenylhydrazine than those of γAOB N. oceani. Our homology modeling studies suggest that different inhibitory responses of βAOB and γAOB are originated from different local environments around the substrate-binding sites of HAOs in these two classes of bacteria due to substitutions of two residues. The results reported herein strongly recommend inhibitor screenings against both NeHAO of βAOB and NoHAO of γAOB to develop HAO-targeting nitrification inhibitors with wide anti-AOB spectra. | |||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
Biochemical and Biophysical Research Communications en : Biochemical and Biophysical Research Communications 巻 476, 号 3, p. 127-133, 発行日 2016-07 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Elsevier | |||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 0006-291X | |||||||||||||||||||||||
| PubMed番号 | ||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | PMID | |||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 27173879 | |||||||||||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 10.1016/j.bbrc.2016.05.041 | |||||||||||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | © 2016 Elsevier Inc. | |||||||||||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | Green open Access | |||||||||||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | この論文は出版社版ではありません。引用の際には出版社版をご利用ください。 | |||||||||||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | This is not the published version. Please cite only the published version. | |||||||||||||||||||||||
| 情報源 | ||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | SC30201706260002 | |||||||||||||||||||||||
| 関連サイト | ||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2016.05.041 | |||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | Biochemical and Biophysical Research Communications | |||||||||||||||||||||||
| 他の資源との関係 | ||||||||||||||||||||||||
| 関連名称 | author manuscript | |||||||||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | AM | |||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||||||||||||||||||||
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Cite as
NISHIGAYA, Yuki, FUJIMOTO, Zui, YAMAZAKI, Toshimasa, 2016, Optimized inhibition assays reveal different inhibitory responses of hydroxylamine oxidoreductases from beta- and gamma-proteobacterial ammonium-oxidizing bacteria: Elsevier, 127–133 p.
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