WEKO3
アイテム
A real-time PCR primer/probe set for reliable identification and quantification of Heterodera glycines
https://repository.naro.go.jp/records/2001683
https://repository.naro.go.jp/records/2001683053ea2c4-f7f8-4d9b-96e4-0abbdac74798
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
postprint_10.116315685411-bja10457.pdf (840 KB)
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.png)
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| Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2026-02-25 | |||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||
| タイトル | A real-time PCR primer/probe set for reliable identification and quantification of Heterodera glycines | |||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||
| 主題 | COI gene, diagnosis, qPCR, soybean cyst nematode, species specificity | |||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||||||||||||
| 著者 |
坂田, 至
× 坂田, 至
× 串田, 篤彦
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||
| 内容記述 | The soybean cyst nematode Heterodera glycines is a major pest in soybean cultivation. Identifying and quantifying nematodes can be achieved through probe-based real-time PCR, and two sets of primers/probes have been developed to target H. glycines. However, we found that one set showed low species specificity, and the other showed significant variations in Ct values among H. glycines populations, potentially leading to inaccurate quantification. Therefore, for more reliable identification and quantification, we developed a novel primer/probe set based on the H. glycines mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene. The novel primer/probe set amplified DNA of all tested H. glycines populations but not that of the other tested species. In addition, there were no significant differences in Ct values among the tested H. glycines populations, indicating accurate quantification across populations using a fixed standard curve. The detection sensitivity of the novel primer/probe set was higher than or comparable to that of the existing primer/probe sets. The novel primer/probe set thus facilitates reliable identification and quantification of H. glycines, supporting decision-making for the appropriate control of H. glycines. | |||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||||||
| 内容記述 | This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published by Brill in Nematology. The final authenticated version is available online at: https://doi.org/10.1163/15685411-bja10457 |
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| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Online Publication Date: 06 Jan 2026 | |||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Nematology 巻 28, 号 2, p. 141-149, 発行日 2026-02 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Brill | |||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 1568-5411 | |||||||||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | hasVersion | |||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 10.1163/15685411-bja10457 | |||||||||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 権利情報 | Authors (Author's final draft manuscript) | |||||||||||||||||||||
| 関連サイト | ||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | hasVersion | |||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1163/15685411-bja10457 | |||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||
| 関連名称 | Publisher's version | |||||||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | AM | |||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa | |||||||||||||||||||||
